최근 mysql 의 my.cnf 에 include룰이 생겨서 변경되었습니다.

클라이언트, 서버 등에 속하는 설정파일들은 /etc/mysql.conf.d에 있을 겁니다. (이곳은 통상 MySQL을 대체하는 MariaDB를 위한 설정이 포함됩니다.)

오래된 MySQL 전용 설정파일의 경우 /etc/mysql/mysql.conf.d/ 에 포함 되어 있게됩니다.

각 디렉토리에서 .cnf 로 끝나는 파일을 모두 읽어서 처리함으로 필요한 설정이 있는 데, 해당하는 파일이 없다면 위 두 디렉토리 중 하나에 파일을 만드셔서 설정하면 됩니다.

예: 클라이어튼 기본 글자 셋 변경하기

## 이 파일은 /etc/mysql/mysql.conf.d/ 에 client.cnf 와 같이 두면 됩니다.
[client]
default-character-set = utf8

마리아DB 전용 설정은

## 이 파일은 /etc/mysql/conf.d/ 에 client.cnf 와 같이 두면 될 것 같네요.
[client-mariadb]
default-character-set = utf8

물론 위의 구분없이 파일 하나로 해서 만들어도 상관없습니다. 단지 관리를 위한것 입니다.

그리고 예전의 사용하던 my.cnf 가 있다면 /etc/mysql/mysql.conf.d/ 에 복사하면 될 것 같네요.